Την παραίτησή του από τη θέση του διευθυντή του Μουσείου Φωτογραφίας Θεσσαλονίκης υπέβαλλε ο Ηρακλής Παπαϊωάννου στην υπουργό Πολιτισμού και Αθλητισμού κυρία Μυρσίνη Ζορμπά.

Η υποβολή της παραίτησης έγινε μια μέρα μετά την ψήφιση στη Βουλή του σχεδίου νόμου για την “Ίδρυση Μητροπολιτικού Οργανισμού Μουσείων Εικαστικών Τεχνών Θεσσαλονίκης” (MΟΜus), αλλά και στις 2 Νοεμβρίου.

Σε ανακοίνωση του ΜΦΘ δίνονται περισσότερες λεπτομέρειες. Σχετικά τονίζεται ότι: «Ο Διευθυντής του Μουσείου Φωτογραφίας Θεσσαλονίκης Ηρακλής Παπαϊωάννου έχει υποβάλει την παραίτησή του στην Υπουργό Πολιτισμού & Αθλητισμού στις 24/10 και εκ νέου στις 2/11.

Ο Ηρακλής Παπαϊωάννου εκφράζει τις ευχαριστίες του προς την πολιτική ηγεσία του ΥΠΠΟΑ για την εμπιστοσύνη στο πρόσωπό του, προς τη Διοίκηση του Μουσείου Φωτογραφίας Θεσσαλονίκης και του Κρατικού Μουσείου Σύγχρονης Τέχνης για τη συνεργασία τα τελευταία τρία σχεδόν χρόνια, προς τους καλλιτέχνες, τους επιμελητές, τους συνεργάτες που στήριξαν το έργο του ΜΦΘ το διάστημα αυτό.

Εκφράζει επίσης τις καλύτερες ευχές του για το ξεκίνημα του νεοσύστατου Μητροπολιτικού Οργανισμού Μουσείων Εικαστικών Τεχνών Θεσσαλονίκης».

Ο ίδιος αναφέρει ως αιτία της παραίτησής του «τη μη ύπαρξη οριστικότερης ή έστω μεταβατικής λύσης στο ζήτημα του προσωπικού του Μουσείου». Το θέμα λοιπόν των θέσεων εργασίας ήταν αυτό που ώθησε τον διευθυντή του Μουσείου Φωτογραφίας στην παραίτηση. Η υπουργός δεν έδωσε καμία απάντηση ούτε στην πρώτη, ούτε και στην δεύτερη υποβολή παραίτησης. Μένει να δούμε τι θα αποκριθεί και τι θα γίνει και με το θέμα του προσωπικού του Μουσείου. Με το νέο νόμο που ψηφίστηκε στις 23/10/2018 προβλέπεται η συνένωση Κρατικού Μουσείου Σύγχρονης Τέχνης, Μακεδονικού Μουσείου Σύγχρονης Τέχνης, Μουσείου Φωτογραφίας Θεσσαλονίκης (ως ιδιαίτερο τμήματα του ΚΜΣΤ), Κέντρου Σύγχρονης Τέχνης Θεσσαλονίκης και Μουσείου Άλεξ Μυλωνά (ως θυγατρικό τμήμα στο ΜΜΣΤ). Το MOMus όπως αποκαλείται εν συντομία ο Μητροπολιτικός Οργανισμός Μουσείων Εικαστικών Τεχνών Θεσσαλονίκης ήταν κάτι που ξεκίνησε ως ιδέα όταν υπουργός Πολιτισμού ήταν ο Παύλος Γερουλάνος και πέρασαν πολλά χρόνια και αρκετοί υπουργοί, και αλλαγές κυβερνήσεων μέχρι να αποκτήσει την τελική του μορφή.

Ο Ηρακλής Παπαϊωάννου γεννήθηκε στη Θεσσαλονίκη το 1962. Σπούδασε Φυσική στο ΑΠΘ και φωτογραφία στο New York Univeristy (Master of Arts). Είναι Διδάκτωρ Φωτογραφίας του Τμήματος Δημοσιογραφίας και Μέσων Μαζικής Ενημέρωσης του ΑΠΘ. Το φωτογραφικό του έργο έχει παρουσιαστεί σε ατομικές και ομαδικές εκθέσεις στην Ελλάδα και το εξωτερικό. Από το 1994 είναι οργανωτικό στέλεχος της Photosynkyria, του ετήσιου διεθνούς φεστιβάλ φωτογραφίας της Θεσσαλονίκης. Από το 2001 εργάζεται στο  Μουσείο Φωτογραφίας Θεσσαλονίκης. Το 2006 υπήρξε καλλιτεχνικός διευθυντής της Photosynkyria. Τα τελευταία δεκαπέντε χρόνια έχει δημοσιεύσει μεγάλο αριθμό κειμένων, δοκιμίων, κριτικών για τη φωτογραφία ενώ έχει επιμεληθεί μεγάλο αριθμό εκθέσεων, ιστορικών και σύγχρονων, στην Ελλάδα και το εξωτερικό, σε συνεργασία με μουσεία και ιδρύματα τέχνης. Εργάστηκε δέκα χρόνια στη φωτογραφική εκπαίδευση. Έχει μεταφράσει έργα για τη φωτογραφία των Villem Flusser, Susan Sontag, Ian Jeffrey.